请假扣除周六周日双倍工资不合法。依据《劳动法》，工资是员工劳动所得的报酬，请假应扣当天工资，扣双倍违法。若长期如此，将严重损害员工权益，影响劳动关系和谐。
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请假扣工资常见处理为按实际请假天数扣减。选择时应确保符合《劳动法》规定，避免违法扣除，维护员工合法权益，同时保证公司规章制度合理合法。
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请假不应扣双倍。操作：1. 明确请假天数，按日扣工资；2. 周末请假，若未安排补班，不应扣工资；3. 特殊情况需扣双倍，需与员工协商并明确告知，确保合法合规。